وتشمل خدمات القسم:

• وحدة للمناظير التشخيصية والعلاجية للمريء والمعدة والأثني عشر والقولون
• مناظير القنوات المرارية العلاجية
• تركيب البالون للسمنة
• إرتجاع المريء
• جرثومة المعدة وتقرحاتها
• عُسر الهضم والإمساك المزمن
• أمراض الكبد المزمنة وأمراض البنكرياس
• المناظير السونارية للجهاز الهضمي والبنكرياس
• مرض السيلياك (حساسية القمح)
• إلتهاب الأمعاء المزمن (مرض القولون التقرحي وكرونز)